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Dr. Stefan Helling
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Post-Doc
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weitere Projekte
11.2009-fortlaufend

Wissenschaftlicher Mitarbeiter im MPC, Ruhr-Universität Bochum 
Thema: Regulation der mitochondrialen Zellatmung durch reversible Phosphorylierung des Elektronentransport-ATP-Synthase-Komplexes.

01.2009-10.2009 Arbeitsuchend und weitere Betreuung der zuletzt bearbeiteten Projekte.
07.2008-12.2008 Wissenschaftlicher Mitarbeiter im MPC, Ruhr-Universität Bochum 
Themen: Identifizierung der Phosphorylierungsstellen boviner Cytochrom c Oxidase im Kontext der Zellatmung und Entwicklung neuer Methoden zur spezifischen Anreicherung Tyrosin-phosphorylierter Peptide.
04.2007-06.2008 Wissenschaftlicher Mitarbeiter im Zentrum für Angewandte Proteomics (Projekt des MPC), Biomedizin-Zentrum Dortmund 
Thema: Entwicklung massenspektrometrischer Methoden zur Glykan-, Glykopeptid- und Phosphopeptid-Analytik.  
03.2003-04.2007 Promotion im Medizinischen Proteom-Center (MPC), Ruhr-Universität Bochum.  "Thema: Analyse differenzieller Membranproteine in regulatorischen CD4+CD25+ und konventionellen CD4+ T-Zellen von Mus musculus". 
12.2001-01.2003 Diplomarbeit am Lehrstuhl "Spezielle Zoologie" der  Fakultät für Biologie, Ruhr-Universität Bochum. "Thema: Aminosäuren und Proteine der Exkremente uninfizierter und Trypanosoma cruzi-infizierterTriatoma infestans (Insecta)". 
06.1999-10.2001  Biologie-Hauptstudium, Ruhr-Universität Bochum
10.1994-05.1999 Biologie-Grundstudium, Universität Bielefeld und Ruhr-Universität Bochum
03.1993-09.1994  Studium der Wirtschafts- und Rechtswissenschaft, Ruhr-Universität Bochum (ohne Abschluss)

Methoden

Proteinauftrennungen:

DIGE-Technologie zur differenziellen Proteom-Analyse.
Verschiedene eindimensionale SDS-PAGE Methoden.
IEF/SDS-PAGE mit isoelektrischer Fokussierung im IPG-System sowie mit Trägerampholyten.
CTAB/SDS-PAGE zur differenziellen Analyse von Membranproteinen.

 

Massenspektrometrie:

nano-LC-ESI-MS/MS (HCTultra PTM Discovery System, Bruker Daltonics und LCQ™Deca XP, Thermo Finnigan)
MALDI-TOF/TOF-MS (Ultraflex™ I und II, Bruker Daltonics)

 

Sonstiges:

Zellkultur, Zelloberflächenmarkierung und Anreicherung zellulärer Kompartimente
Western-Blots zur Proteindetektion mittels Antikörper.
Quantitative RT-PCR für den Vergleich von mRNA-Expressionen.
Peptidauftrennungen mittels HPLC (µ-/nano-HPLC)
Analyse und Charakterisierung von posttranslational modifizierten Proteinen (Phosphorylierungen, Glykosylierungen)

EDV:

Microsoft Windows und Mac OS X
MS Office und Bildbearbeitungsprogramme (Photoshop, Corel Draw)
Auswerteprogramme für Massenspektrometrie- und Proteomdaten (DataAnalysis, DeCyder, DTA-Select, Hystar, Image Master 1D-Elite, Mascot, ProFound, Protein Prospector, ProteinScape, SEQUEST)

 

Helling S., Brosseron F., Shinde S., Sellergren B. and Marcus K., A synthetic imprinted polymer receptor for the selective enrichment of tyrosine phosphorylated peptides. Nat Methods (in Bearbeitung)

Schwarz A., Helling S., Collin N., Teixeira C.R., Medrano-Mercado N., Hume J.C., Assumpção T.C., Marcus K., Stephan C., Meyer H.E., Ribeiro J.M., Billingsley P.F., Valenzuela J.G., Sternberg J M., Schaub G.A., Immunogenic salivary proteins of Triatoma infestans: Development of a recombinant antigen for the detection of low-level infestation of triatomines. PLoS Negl Trop Dis, 2009,  3, e532

Helling S., Vogt S., Rhiel A., Ramzan R., Wen L., Marcus K. and Kadenbach B, Phosphorylation and kinetics of mammalian cytochrome c oxidase. Mol Cell Proteomics, 2008, 7, 1714-1724

Helling S., Analyse differenzieller Membranproteine in regulatorischen CD4+CD25+ und konventionellen CD4+ T-Zellen von Mus musculus. Dissertation, 2007, Fakultät für Biologie, Ruhr-Universität Bochum

Helling S., Schmitt E., Joppich C., Schulenborg T., Mullner S., Felske-Muller S., Wiebringhaus T., Becker G., Linsenmann G., Sitek B., Lutter P., Meyer H.E. and Marcus K. 2-D differential membrane proteome analysis of scarce protein samples, Proteomics, 2006, 6, 4506-4513

Helling S., Aminosäuren und Proteine der Exkremente uninfizierter und Trypanosoma cruzi-infizierter Triatoma infestans (Insecta). Diplomarbeit, 2003, Fakultät für Biologie, Ruhr-Universität Bochum